La déclaration de CIR doit être réalisé à l'aide du formulaire n°2069-A-SD. Ce formulaire intégré à la liasse fiscale de l'entreprise et télédéclaré. La déclaration de CIR doit donc suivre le calendrier fiscal de l'entreprise. Dans sa formule, il convient d'identifier l'entreprise, d'identifier le champ d'application de la R&D et de distinguer l'ensemble des dépenses de R&D. Le formulaire suit donc le mode de calcul du CIR. Le principe déclaratif du CIR ne permet pas à l'entreprise de joindre l'ensemble de la justifications des dépenses de CIR à sa déclaration. Elle peut donc attendre un demande pour transmettre l'ensemble des pièces ou éventuellement faire un rescrit fiscal.